Recorrido por Hv1: un canal selectivo de protones

Abstract

A lo largo del cuatrimestre se fueron introduciendo diferentes métodos y técnicas bioinformáticas para el estudio de proteínas. Este análisis se propone estudiar de forma secuencial, estructural y funcional al canal voltaje operado en humanos, Hv1. Para esto, se realizó una búsqueda de homología, fijando los parámetros necesarios. Luego, con alguna de estas secuencias encontradas, se hizo un alineamiento múltiple para corroborar la importancia de Asp112 en la selectividad de los protones. También se realizó la predicción de estructura secundaria y se modeló la estructura terciaria. Se construyó, además, un árbol filogenético utilizando secuencias de proteínas homólogas de distintos mamíferos que expresan el canal. Por último, se hizo un análisis de la función del canal.