Evaluación de la transferencia conjugativa de plásmidos de rizobios

Abstract

La amplia distribución de elementos genéticos transmisibles en rizobios con amplia representatividad de plásmidos auto-transmisibles portadores de funciones simbióticas, hace del estudio funcional de la transferencia horizontal de genes (HGT) uno de los focos de análisis más relevantes para la comprensión de los mecanismos de adaptación, especiación y plasticidad de los genomas de estos microorganismos del suelo. La transferencia conjugativa (TC) es uno de los mecanismos más relevantes de la HGT, y hace ya algunos años que han sido descriptos mecanismos particulares de regulación de la TC en rizobios (Tun-Garrido et al., 2003, Pérez-Mendoza et al., 2005). Recientemente, en nuestro laboratorio, hemos identificado mediante el análisis filogenético de la proteína TraR, el regulador maestro de la TC en sistemas que poseen dicha proteína, cuatro grupos de plásmidos de rizobios: I-A, I-B, I-C y I-D (Castellani et al., 2019). El plásmido que utilizamos como modelo de estudio en nuestro laboratorio, pLPU83a, es un plásmido de Rhizobium favelukesii LPU83 que pertenece al grupo I-C. Este grupo presenta una distribución de genes conjugativos muy similar a aquellos cuya TC está mediada por Quorum Sensing, caracterizados por la presencia de traR entre la región implicada en la transferencia y replicación del DNA (Dtr, DNA transfer and replication) y la región involucrada en la síntesis del aparato conjugativo (Mpf, Mating pair formation). A su vez, hemos identificado en el grupo I-C, otros plásmidos como pSmeSM11b y pRL8 de Sinorhizobium meliloti SM11 y Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841, respectivamente. Sin embargo, desconocemos el fenotipo conjugativo de dichos plásmidos. Durante el transcurso de este trabajo se proponen estudios básicos con el objetivo de marcar los plásmidos mencionados y evaluar el fenotipo conjugativo de los mismos.