Uno de los temas abordados por la Fitopatología, es la patogenia que estudia el desarrollo del patógeno en el hospedante, o sea su ciclo biológico. Las enfermedades de las plantas son de naturaleza cíclica haciendo referencia a la aparición, desarrollo y establecimiento de una enfermedad y no a la asociación de la patología con el ciclo del patógeno (Agrios, 1995). Esto explica el aumento de los daños a lo largo de una temporada de cultivo y la reaparición del problema al año siguiente.
La interacción de un microrganismo patógeno con una planta hospedante no basta para que se produzca la enfermedad, deben además existir las condiciones ambientales predisponentes, esto es las condiciones de humedad y temperatura que contribuyen a la infección de la planta por parte del agente patógeno.