El diagnóstico de las enfermedades neurológicas en un paciente equino es un verdadero desafío dado que suelen observarse signos inespecíficos como, conductas anormales, desórdenes mentales, y alteraciones de la marcha, dificultando la ubicación exacta del problema. Otra limitante en el diagnóstico, es que el examen de los reflejos medulares sólo puede realizarse en neonatos, ya que resulta más fácil colocarlos transitoriamente en decúbito lateral que a un caballo adulto.
A los efectos de esclarecer la localización aproximada del sitio afectado, es necesario tener conocimiento de la anatomía y de las funciones de las diferentes partes del sistema nervioso central y periférico.
Con frecuencia, sólo después de realizar un examen completo puede confirmarse si existe o no una alteración neurológica diferenciándola de otras alteraciones, por ejemplo del aparato musculo-esquelético.