Encephalitozoon cuniculi es un patógeno intracelular obligado, unicelular y formador de esporas. Su hospedador primario es el conejo. Se lo considera un agente zoonótico oportunista, sobre todo en pacientes inmunocomprometidos.
La infección ocurre al inhalar o ingerir esporas de microsporidios presentes en el ambiente. El ciclo biológico es directo. Los conejos infectados pueden cursar la enfermedad de manera subclínica y manifestar sintomatología cuando ocurre inmunodepresión, y puede ocasionar la muerte del animal. La manifestación clínica abarca tres sintomatologías principales: neurológica, renal y ocular. La condición neurológica es la más reportada en esta especie. En Argentina no existe vacunación preventiva y no hay un consenso sobre el tratamiento. En el presente trabajo se describe el abordaje diagnóstico, tratamiento y evolución de un caso de encefalitozoonosis en un conejo mascota macho, que fué llevado para su atención al Consultorio Externo de Animales No Tradicionales del Hospital Escuela, FCV UNLP, presentando como signo inicial de enfermedad inclinación cefálica hacia el lado izquierdo. El contacto de este animal con sus congéneres alertó sobre una posible transmisión horizontal, que se evaluó mediante la tinción Gram-cromotropo 2R en los animales vivos, y en aquellos que fallecieron se realizó necropsia e histopatología.