Con el objetivo de investigar los procesos culturales comprendidos en la historia de poblamiento bonaerense, desde hace cuatro décadas, se desarrollan en la región comprendida por el Sistema Serrano de Ventania y su llanura adyacente, proyectos de investigación arqueológica acreditados por las Universidades Nacionales de La Plata y Rosario. El área de investigación ubicada en el sector sur del Área Ecotonal Húmedo Seca Pampeana, fue habitada por sociedades humanas que se sucedieron en el tiempo desde hace al menos 6.000 años A.P. Es posible aproximarnos a conocer los modos de vida de las mismas a través del estudio de su cultura material. Resulta pertinente señalar que cada sociedad posee sistemas de universos simbólicos compartidos que le son propios y se expresan en diferentes soportes materiales, una de las manifestaciones plásticas arqueológicas vinculada a los primeros pobladores es el arte rupestre. En el área de estudio existen numerosas cuevas y aleros donde se llevó a cabo este tipo de registro. Una gran proporción de estos sitios se encuentran emplazados en las áreas protegidas: Reserva Natural Sierras Grandes y el Parque Provincial Ernesto Tornquist. El arte rupestre es entendido como las expresiones gráficas llevadas a cabo por el ser humano en un soporte rocoso. El repertorio gráfico de las representaciones rupestres allí registradas se caracteriza por la presencia de motivos pintados, mayormente geométricos, con predominio de los motivos de líneas paralelas, concentraciones de puntos, zig-zags y triángulos opuestos por el vértice. Se trata de un tipo de registro altamente vulnerable que sólo puede ser apreciado y estudiado en relación con su entorno (Panizza 2013). Las sociedades humanas producen una variedad de estresores físicos, químicos, biológicos y culturales que generan impactos negativos en la integridad de este registro arqueológico. Por este motivo, la evaluación de estos impactos resulta de suma importancia para generar estrategias de conservación del patrimonio arqueológico bonaerense. El objetivo de este trabajo es presentar la propuesta metodológica de investigación implementada en la evaluación del impacto ambiental sobre las pinturas rupestres localizadas en áreas protegidas del sector sur del Área Ecotonal Húmedo Seca Pampeana. Para tales fines, se ha implementado un enfoque transdisciplinar integral que conjuga herramientas de las ciencias ambientales, la biología, la arqueología, y el campo de la comunicación, entre otros. Este estudio permite una aproximación a los agentes naturales y culturales involucrados en los procesos de deterioro patrimonial. Por este motivo, los resultados obtenidos a partir de este tipo de análisis permitirán la elaboración de medidas de mitigación y protección del patrimonio arqueológico en diversos contextos regionales.