El sistema estuarial del Río de la Plata (RdP) se caracteriza por la presencia de tres grandes regiones faunísticas bentónicas: agua dulce, mixohalina y marina. Estas regiones están interconectadas entre sí, en grados diferentes, a través de gradientes ambientales y biológicos. El análisis de los patrones de diversidad y sus relaciones con el cambio salino y otras variables ambientales asociadas (e.g. los cambios en turbidez y los tipos sedimentarios) pueden ser utilizados para caracterizar y diferenciar las diferentes regiones de un sistema estuarial. Las relaciones entre la diversidad bentónica y la salinidad en estuarios suele ser descripta mediante modelos cuantitativos lineales basados en los valores de salinidad, sin considerar los gradientes salinos. En este trabajo se presentan algunas de las ventajas y desventajas de los distintos modelos utilizados para estudiar la diversidad y su relación con la salinidad en otros estuarios.