El objetivo central del presente trabajo consiste en estudiar el proceso de adsorción de proteínas sobre estructuras nanoporosas de SiO₂ utilizando técnicas de simulación molecular. Distintas proteínas (citocromo c, lisozima y mioglobina) se emplearon como modelos de grano grueso basados en sus estructuras cristalográficas. Mientras que el material nanoporoso fue modelado mediante un único poro cilíndrico con propiedades que asemejan al SiO₂. Nuestro enfoque teórico-computacional al problema permite el estudio de sistemas macromoleculares en función de las condiciones del medio, logrando alcanzar escalas espaciales del orden de decenas de nanómetros, considerando el tamaño, la forma, la distribución de carga, las configuraciones y los estados químicos de las diferentes especies químicas presente en el sistema.