El uso de antibióticos sintéticos y productos químicos en acuicultura para el control de parásitos genera riesgos ambientales y sanitarios, como resistencia antimicrobiana y daños a organismos acuáticos. Por ello, crece el interés en alternativas naturales. Este estudio evaluó el eugenol como agente eutanásico y su impacto en infecciones parasitarias en Cnesterodon decemmaculatus, pez dulceacuícola neotropical ampliamente distribuido en Sudamérica. Durante 2022, se recolectaron 298 especímenes estacionalmente en el Lago del Bosque, La Plata, Argentina. Los peces se mantuvieron en laboratorio con agua del sitio a 25 °C, con ciclo 12/12 h luz/oscuridad por dos semanas. Se midieron la longitud estándar (LE) y total (LT), se pesaron y sexaron vivos. Los peces tratados (n=228) fueron sacrificados con eugenol (50 mgL-1 ) y los controles (n=68), por decapitación. Luego, se realizó el análisis parasitológico examinando piel, branquias y órganos internos. Se detectaron Trichodina spp. (TS) en la piel, Echinostomatidae (EB) y Ascocotyle sp. en branquias (AB), Ascocotyle sp. en corazón (AC), Pygidiopsis sp.(Pyg) en hígado y cavidad celómica, y Saccocoelioides kirchneri (Sac) en intestino. El eugenol, redujo significativamente la Abundancia Media (AM) de Trichodina spp. (p = 0.001). Además, los peces de tallas superiores presentaron mayor carga parasitaria en Trichodina spp., con asociaciones significativas para LT (p = 0.03) y LE (p = 0.02). Se observaron diferencias estacionales en Echinostomatidae, Trichodina spp. y Ascocotyle sp. presentes en corazón. Los tiempos de exposición al eugenol variaron según el tipo de infección pasaritaria, con diferencias significativas en AH (282 s vs. 365 s; p = 0.01). En general, los individuos infectados mostraron tiempos de exposición más bajos que los no infectados. Este estudio aporta conocimiento sobre antiparasitarios naturales en acuicultura y su potencial en estrategias sostenibles de control de parásitos, resaltando la importancia de integrar factores ecológicos y características del hospedador en el manejo parasitario.