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dc.date.accessioned 2022-08-17T15:45:35Z
dc.date.available 2022-08-17T15:45:35Z
dc.date.issued 2021
dc.identifier.uri http://sedici.unlp.edu.ar/handle/10915/140594
dc.description.abstract Al analizar un transcriptoma en primera instancia se debe realizar un pre-procesamiento computacional de las lecturas de transcriptos generados por secuenciadores masivos y posterior obtención de la expresión diferencial de los genes asociados a muestras control y tratadas. Los genes cuantificados deben ser caracterizados con el fin de obtener toda la información posible de la secuencia del genoma, para luego ser anotados funcionalmente. En ese sentido, el desarrollo de un buscador de metadata asociada a cada lectura de manera personalizada para cada experimento y/o especie conlleva grandes ventajas. A la hora de procesar los datos, a partir del nombre del gen o secuencia puede obtenerse, por ejemplo, la descripción de la proteína, los términos GO, vías de Uniprot, así como resúmenes sobre las categorías funcionales. En el presente trabajo, se utilizó como punto de partida una tabla de expresión diferencial obtenida a partir del procesamiento bioinformático de la colección biológica PRJNA417324 y mediante la técnica de raspado web, empleando el programa Beautiful Soup, se obtuvo metadata asociada para cada transcripto a partir de la base de datos UNIPROT. es
dc.format.extent 85-93 es
dc.language es es
dc.subject Raspado web es
dc.subject Transcriptómica es
dc.subject Metadata es
dc.title Generación de una herramienta para la búsqueda de metadata asociada a transcriptos es
dc.type Objeto de conferencia es
sedici.identifier.uri http://50jaiio.sadio.org.ar/pdfs/cai/CAI-13.pdf es
sedici.identifier.issn 2525-0949 es
sedici.creator.person Machado, Rodrigo es
sedici.creator.person Moschen, Sebastián es
sedici.creator.person Gónzalez, Sergio Alberto es
sedici.creator.person Conti, Gabriela es
sedici.creator.person Massaro, Mora es
sedici.creator.person Di Rienzo, Julio Alejandro es
sedici.creator.person Burdyn, Lourdes es
sedici.creator.person Hopp, Horacio Esteban es
sedici.creator.person Fernández, Paula es
sedici.subject.materias Ciencias Informáticas es
sedici.description.fulltext true es
mods.originInfo.place Sociedad Argentina de Informática e Investigación Operativa es
sedici.subtype Objeto de conferencia es
sedici.rights.license Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 3.0 Unported (CC BY-NC-SA 3.0)
sedici.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/
sedici.date.exposure 2021-10
sedici.relation.event XIII Congreso de AgroInformática (CAI 2021) - JAIIO 50 (Modalidad virtual) es
sedici.description.peerReview peer-review es


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