Minería de datos sobre comunidades biológicas

Abstract

La práctica científica y tecnológica suele reunir conceptos originados en diversas disciplinas para desarrollar perfiles y potenciales usos que adquieren cierta unidad e independencia conceptual. Tal es el caso de data mining que a partir de la tecnología de las bases de datos incorporó paulatinamente ideas provenientes de la inteligencia artificial y de la estadística para clasificar y/o predecir resultados sobre un muy variado conjunto de sistemas. El proyecto de investigación aquí presentado estudia técnicas bioinformáticas con las que se trabaja sobre comunidades microbiológicas de suelos. Tales métodos tienen el propósito de clasificar los organismos que forman parte del medio y predecir su diversidad. El análisis parte de la representación computacional del ADN que codifica la información genética y establece, con datos obtenidos a partir de muestras, las propiedades del conjunto de microorganismos que conforman esa comunidad. Este tipo de estudio, denominado metagenómica, permite agrupar los distintos tipos de organismos en clusters que representan alguna categoría taxonómica como especie, género, familia etc. También es posible a partir de estos agrupamientos realizar estimaciones de biodiversidad que proporcionen información sobre la potencialidad y riqueza del suelo. El proyecto de investigación tiene dos objetivos. Por un lado establecer un modelo bioinformático markoviano para la comparación de secuencias de ADN a efecto de clasificación, y por otro presentar un análisis crítico de los procedimientos de data mining aplicados a la evaluación de la riqueza en distintos ecosistemas.