Segmentación de contornos celulares utilizando estimadores fractales

Abstract

La segmentación en imágenes biológicas es de importancia crucial para la determinación de descriptores que permitan, entre otras cosas, elaborar modelos de diversos procesos biológicos, cotejar parámetros en dichos modelos, y proponer o rebatir teorías. Sin embargo, el proceso de segmentación de la información necesaria para el cómputo de los descriptores es casi siempre un proceso asistido, dado que la calidad de las imágenes que se pueden generar con la tecnología actual de microscopía clásica, adolecen de defectos que impiden el uso adecuado de técnicas de segmentación autónoma. En este trabajo se propone el uso de la dimensión fractal box (FBD) como descriptor local, para la segmentación de imágenes de microscopía de la piel de embriones de anfibios en las que, usando técnicas de imnunofluorescencia, se ha marcado E-Cadherina, una molécula de adhesión celular, expresada en membranas celulares y responsable de la adhesión dependiente de Ca2+. El propósito del presente trabajo fue elaborar un workflow de procesamiento para ser aplicado sin supervisión a un grupo no determinado de imágenes de la misma naturaleza, de las que se intenta extraer la información requerida para los propósitos de caracterización y eventual cuantificación.