Estudio comparativo de métodos de cálculo empleados en el análisis conformacional de moléculas de interés farrnacológico

Abstract

En este trabajo presentamos un estudio conformacional comparativo empleando diferentes métodos de cálculo en algunas moléculas de interés farmacológico: histamina, α(R), β(S) dimetilhistamina y anfetamina. En este estudio se incluye también una discusión sobre la conveniencia de la utilización de los diferentes métodos de cálculo en estudio de modelado molecular para el diseño de fármacos. Este análisis se realizó en base al tiempo de cálculo requerido en relación con la cantidad y calidad de información que es posible obtener. Nuestros resultados muestran que cálculos de Mecánica Molecular, muy simples, pueden resultar sumamente útiles en el estudio conformacional general de moléculas biológicas como las aquí presentadas, dando resultados muy similares a los obtenidos con métodos más sofisticados (AMI y ab initio 3-21G y 4-31G). Sin embargo, en aquellos casos en que se requiere una infor- mación precisa sobre barreras rotacionales y posibilidades de interconversión entre los confórmeros, resulta necesario la utilización de cálculos más exactos

A comparative conformational study of biologically active molecules (histamine, α(R)) , β(S) dimetilhistarnine and anfetamine was carried out using different calculation methods. Also, a discussion about the utility of different calculation techniques used in molecular modeling was included in the present report. The above analysis was carried out taken into account the calculation time required with respect to the quality of information obtained. Our results indicate that very simple molecular mechanic calculations may be useful in the general conformational study of biological molecules, giving results close related wiih those obtained from AMI or a b initio 3-21G, 4-31G calculations. However, ab initio calculations appears to be esentials in those cases in which a precise description about rotational barriers and interconversion amoung the different conformers are necesary.