Desarrollando un entorno de trabajo para integración, curado y utilización de datos genómicos

Abstract

En este trabajo se presenta el desarrollo de un entorno de almacenamiento y manipulación de datos genómicos, nacido a partir de la necesidad de contar con un esquema de datos que permita el trabajo colaborativo sobre un conjunto de datos bien caracterizados,, posibilitando la integración de diferentes análisis y el máximo aprovechamiento de la información. Este entorno, basado en un esquema Chado, con un navegador y una interface web para el acceso a los datos, e integrado a herramientas comunitarias como Galaxy que facilita el uso recursos de worklofws de procesamiento, representa un esquema muy difundido en la actualidad en varios proyectos genómicos, facilitando la integración e interpretación de datos y siendo la base para futuros avances en el manejo de información genómica.

In this work we describe the development of a storage and manipulation environment for genomic data, created to satisfy the need for a data schema allowing collaboration over a well characterized data set and the integration of data from different analysis. this environment, based on Chado, with a browser and a web interface, integrating community tools such as Galaxy for workflow processing, represents a well known scheme from various modern genomic projects, allowing data integration and interpretation, being a good base for future advances in genomic information management.