Aguilar Villanueva sitúa como campo central de sus indagaciones y reflexiones el de la Administración Pública moderna, cuya problemática y universo de sentido es la gobernación, es decir "la (re)construcción de la capacidad de gobernar del gobierno y la fundación de los modos apropiados de gobernar en las condiciones sociales actuales de escasez, adversidad e incertidumbre".