El control del mosquito Aedes aegypti ha tomado especial importancia en los últimos años debido a que es vector de varios arbovirus causantes de enfermedades. El control masivo con insecticidas químicos ha provocado focos de resistencia en diferentes partes del mundo, por lo que las herramientas alternativas de control, como los hongos entomopatógenos, ha tomado gran impulso en los últimos años para afrontar este problema. En el presente estudio reporta que M. robertsii (ARSEF 2575) exhibe cambios moleculares y ultraestructurales durante la formación de microesclerocios y ante el estímulo de factores abióticos como la temperatura y la radiación UV, a los que se muestran relativamente tolerantes. También reporta que aislamientos de Metarhizium de origen platense (CEP 83 y CEP 423) exhibe producción de microesclerocios y mayor producción de conidios infectivos comparado con los pellets, otro propágulo granular producidos por los mismos aislamientos. El aislamiento modelo (ARSEF 2575) exhibió una mayor producción de microesclerocios y de mayor tamaño que los los aislamientos locales CEP 83 y CEP 423, aunque estos últimos mostraron mayor capacidad de conidiogénesis a partir de microesclerocios maduros. Los 3 aislamientos redujeron la sobrevivencia de Ae. aegypti expuestas a sus microesclerocios. La interacción hongo-larva generó una respuesta en el hospedador que se evidenció con la expresión de genes de su sistema inmune humoral, aunque lo hizo tardiamente (9 días post infección) cuando la infección fúngica se consolidaba como un proceso exitoso que culminó con la mortalidad de las larvas tratadas. Los microesclerocios de Metarhizium spp. son prometedores para el control microbiano ya que producen conidios continuamente en las condiciones adecuadas. Son pocos los reportes de la utilización de microesclerocios para el control de vectores de enfermedades humanas. El presente estudio abre el camino para explorar el uso de estos propágulos de resistencia fúngico como larvicidas.