Entamoeba coli es una ameba no patógena, parásito comensal del intestino grueso. Su diagnóstico sirve como indicador de contaminación fecal del ambiente. Durante el diagnóstico parasitológico es posible observar quistes inmaduros que pueden asemejarse a los quistes de E. histolytica (especie parásita patógena). Como se trata de especies de diferente patogenicidad, se debe tener en cuenta un conjunto de características morfológicas y técnicas a emplear para una correcta diferenciación.