El clima en la Patagonia está caracterizado principalmente por un elemento meteorológico, el viento, por su constancia e intensidad. La zona del Alto Valle, tiene un clima desértico frío con verano cálido. Utilizando información del período 1961 a 1990 se obtuvo que la distribución de frecuencias de direcciones de viento que en Neuquén y Alto Valle presenta direcciones predominantes del Sudoeste-Oeste. En Alto Valle las frecuencias del viento proveniente de los sectores Norte y Sur muestran valores menores debido a la presencia de los bordes de la meseta que actúan en forma de paredes, insinuando efectos de conducción del flujo dentro del valle. En Cipolletti, ubicada cerca de la confluencia de los dos valles, el aire fluye con dirección preferencial de los sectores Oeste y Sudoeste, siguiendo el valle del río Limay. Esto verificaría la acción de los bordes del valle del río Neuquén, contribuyendo a disminuir la componente de viento perpendicular al mismo. La intensidad media mensual del viento en la zona puede llegar a valores superiores a 4.0 m/s.