No es lo que parece: sitios diagnóstico revertantes en el ADN mitocondrial

Abstract

Presentamos dos casos de reversión de los sitios diagnóstico usualmente utilizados para determinar haplogrupos mitocondriales americanos. Durante la caracterización de los linajes maternos en 504 individuos de tres poblaciones cosmopolitas argentinas por medio de secuenciación de la Región Control y/o tipificación de los marcadores clásicos de haplogrupos A-D mediante PCR-RFLP y PCR-AFLP encontramos cuatro casos de discordancia en la asignación de haplogrupos. Luego de descartar la posibilidad de error humano, confirmamos la existencia de individuos que, aunque portadores de secuencias asignables a los haplogrupos A2 (N=2) y C1c (N=2), carecieron de los esperados polimorfismos haplogrupo-específicos +HaeIII 663 y +AluI 13262, respectivamente. El análisis mediante PCR-RFLP de otros once individuos C1c cuyas secuencias estaban disponibles nos permitió descubrir otros dos revertantes. Con el objetivo de comprender las bases moleculares de ambas reversiones secuenciamos las regiones alrededor de las posiciones 663 y 13263 en los seis casos. En ausencia de recombinación, nuestros hallazgos son compatibles con la ocurrencia de reversiones al estado ancestral de las mutaciones haplogrupo-específicas A663G en los linajes A2 y A13263G en los linajes C1c. Los revertantes A2 provienen de Tartagal (Salta), siendo uno de ellos de ascendencia materna tarijeña y el otro de origen guaraní. Ambos poseen idéntica secuencia de la Región Control, y linajes afines han sido descriptos en mestizos e indígenas (guaraníes Ñandeva y Kaiowá) de Brasil. Los revertantes C1c son portadores de la secuencia nodal para el haplogrupo y fueron encontrados en las ciudades cuyanas de Mendoza (N=2), Lavalle (N=1) y San Juan (N=1).