En el caso concreto de la Comunidad Andina de Naciones (Bolivia, Colombia, Ecuador, Perú y Venezuela) y del MERCOSUR (Argentina, Brasil, Paraguay y Uruguay) la negociación del ALCA incidió en que se prestara más atención a la negociación entre estos dos grupos de integración subregional, como forma de compensar o asegurar su presencia dentro de ambos mercados antes de la firma de un acuerdo hemisférico.