La fauna de reptiles del Paraguay constituye una de las menos conocidas en Sudamérica. La Colección Zoológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (CZCEN) contiene registros sin publicar del Paraguay, por lo que realizamos una lista del material de la Colección, discutiendo la distribución de las especies y nuevos registros en el Paraguay. La CZCEN conserva 137 especímenes correspondientes a dos especies de tortugas, cuatro de anfisbenas, dieciséis de saurios y cuarenta de serpientes.