El IOMA cuenta con un Sistema Integral de Prótesis, que va desde la solicitud de los elementos a implantar hasta el pago de los mismos a los actores intervinientes para la atención de afiliados en clínicas, hospitales y sanatorios privados ubicados en la provincia de Buenos Aires. Los efectores están agrupados en entidades intermedias con las cuales el Instituto tiene convenio para la atención de afiliados que necesitan realizarse cirugías, para implantar elementos protésicos que se encuentran dentro de un nomenclador propio de la Obra Social. El Sistema Integral de Prótesis tiene como objetivo principal, el asegurar que a los afiliados se le implanten los elementos que correspondan, ya sea tipo y procedencia de lo solicitado. Que una vez realizada la cirugía le sea entregado al paciente el certificado de implante correspondiente. Verificar las actuaciones de los profesionales actuantes que realizan las solicitudes, observando las distintas respuestas que efectúan los proveedores intervinientes en las entregas de elementos en los efectores. Todo esto con los controles correspondientes previniendo inconsistencias y generando transparencia en todo el proceso de prótesis, desde la solicitud hasta el pago. En el sistema están involucrados varios actores: fabricantes, importadores, distribuidores, clínicas, entidades intermedias y el IOMA.