El objetivo del presente estudio consistió en evaluar la posible asociación entre marcadores genéticos y el nivel de Gonadotrofina Coriónica equina (eGC). La eGC es una hormona glicoproteica producida por las células del trofoblasto fetal que invaden el endometrio uterino. Esta invasión desencadena una respuesta inmunológica de la madre contra los genes del Complejo Mayor de Histocompatibilidad (MHC) paterno, expresados en la superficie de las células invasoras. La vida media de las copas endometriales secretoras, está determinada básicamente por la mencionada respuesta inmunológica materna (Allen y Moor, 1972), la que interviene directamente sobre las mismas, no existiendo mecanismos hormonales de retrorregulación (Murphy y Martinuk, 1991; Hoppen 1994). En el presente trabajo se analizaron la transferrina y cinco microsatélites autosómicos. La transferrina fue seleccionada por su función biológica relacionada con el estado general del animal y del endometrio en particular. En el caso de los microsatélites empleados se eligieron por conformar grupos de ligamiento con genes de MHC equino, cuya expresión influye sobre el nivel de producción de la eGC. La muestra analizada estuvo compuesta por equinos mestizos, propiedad de la empresa Syntex S.A., destinados a la producción de eGC. Los ejemplares se encuentran en un campo de cría ubicado en la localidad de Ayacucho, Provincia de Buenos Aires.