Clasificación por enterotipos y grupos ortólogos del microbioma humano con métodos no supervisados

Abstract

Se relatan las tareas llevadas a cabo por el Grupo de Investigación y Desarrollo en Data Mining del Departamento de Ingeniería e Investigaciones Tecnológicas de la UNLAM durante el año 2015 en el marco del Proyecto de Incentivos C169 “Aplicaciones de Data Mining al Estudio del Microbioma Humano”. Se detallan las pruebas realizadas con el software SUPERFOCUS y la base de datos genéticos SEED, para desarrollar los análisis taxonómicos y funcionales que prepararan la información de las secuencias microbiómicas para procesarla con algoritmos de data mining. Se explicitan los aspectos teóricos y prácticos de la aplicación de estos algoritmos sobre conjuntos de prueba. Se analiza la interpretación clínica dada a los resultados y finalmente se describen los cursos de acción para continuar con la investigación durante 2016.