La investigación del biodeterioro en material cerámico arqueológico ha sido escasamente abordada en contraste con otros sustratos arqueológicos. En el presente estudio se caracteriza la acción biodeteriorante, en el sustrato cerámico, a partir de la identificación de las especies de cianolíquenes presentes en las superficies y cantos de los fragmentos y microorganismos que desarrollan en el interior de la matriz en comunidades complejas. Las observaciones y análisis de superficies fueron realizadas por diferentes técnicas microscópicas (microscopio óptico, microscopio electrónico de barrido y espectroscopia por energía de dispersión de rayos X). Nuevas estrategias de control y prevención serán aplicadas para mitigar el biodeterioro.