Cladosporium fulvum es el agente causante del “Moho de la hoja de tomate”, una de las patologías del cultivo de tomate bajo cubierta en el cinturón hortícola platense (Argentina). En estudios previos se determinó que en las áreas de producción muestreadas sólo se encuentran dos razas del hongo, la “0” y la “2”, y que los aislados presentan polimorfismo a nivel de los genes avr. Estos resultados sugieren la ocurrencia de procesos evolutivos o cambios genéticos cuyo resultado sería la aparición de una nueva raza. Por ello, el objetivo de este trabajo es conocer más sobre la diversidad de las poblaciones del patógeno que se encuentran en las áreas de cultivos hortícolas. Para ello se realizaron más aislados del patógeno y por medio de la Multiplex PCR se identificaron las razas a las que pertenecen. Además, se evaluó la diversidad genética con marcadores ISSR. La amplificación de los genes de avirulencia confirmó que los aislados son C. fulvum. Se determinó que prevalece la raza “2” sobre la “0” en un 81%. Se encontró un polimorfismo de 52,9% entre los amplicones de ISSR lo que sugiere que la diversidad de la población es considerable, la que resulta de cambios a nivel genético, que ocurren en el genoma, entre otros sitios en los avr.