Blastocystis es uno de los parásitos intestinales zoonóticos de mayor prevalencia y de distribución mundial. Es un organismo unicelular, anaerobio, cuya taxonomía ha sido motivo de estudios, controversias y revisiones. Se caracteriza por una gran variabilidad genética, con la existencia de al menos 10 genotipos o subtipos, lo que hace dificultoso su estudio y que ha llevado también a controversias en cuanto a características morfológicas, ciclo vital y su rol como patógeno tanto en una amplia variedad de animales como en humanos. El subtipo 3 es el genotipo más frecuentemente hallado en el hombre. Su potencialidad patogénica estaría asociada a un determinado subtipo que aún no se ha definido completamente por estudios moleculares.
En nuestro grupo hemos efectuado relevamientos epidemiológicos a fin de detectar la presencia del parásito en diversas fuentes. En estudios sobre poblaciones infantiles en zonas periféricas de La Plata hemos hallado que sobre 408 muestras, el 45 % de ellas estaban parasitadas y el 56 % por Blastocystis.