Análisis de linajes maternos y paternos de bovinos criollo del Centro de Ecología Aplicada Simón I. Patiño - Bolivia

Abstract

Se determinaron los linajes maternos y paternos de 33 bovinos Criollo (27 hembras y 6 machos) del Centro de Ecología Aplicada Simón I. Patiño (Ceasip) mediante marcadores genéticos del ADN genómico, mitocondrial y del cromosoma Y. El ADN genómico se extrajo utilizando el kit Wizard® Genomic Purification. Los linajes maternos se determinaron mediante secuenciación del ADN mitocondrial (región control D-loop) y los linajes paternos se determinaron analizando siete marcadores genéticos del cromosoma Y, dos SNP (Polimorfismo de Nucleótido Simple) y cinco microsatélites (Secuencias Repetidas en Tándem). La diversidad genética se estimó tipificando 18 microsatélites. Se analizaron los datos con MStools, GenePop y Arlequin. La secuenciación de D-loop mitocondrial permitió detectar seis linajes maternos, que incluían cuatro haplotipos mitocondriales de origen europeo y dos africanos. A través del análisis de los marcadores del cromosoma Y se determinaron tres linajes paternos, dos taurinos y uno cebuino. En el hato del Ceasip, la diversidad alélica (n_a) fue de 6.11, mientras que la heterocigosidad esperada (H_e) fue de 0.70 y la observada (H_o) fue de 0.68. Los valores de diversidad genética observada en los bovinos del Ceasip son similares a los estimados para la mayoría de los biotipos del Criollo boliviano (n_a Yacumeño= 6.82; n_a Saavedreño= 5.95), siendo los valores promedios para el ganado Criollo boliviano analizados anteriormente de n_a= 6.39, H_e= 0.72 y H_o= 0.65. Los análisis de Componentes Principales y de distancia genética mostraron que sería factible intercambiar material genético entre las poblaciones Criollo bolivianas sin pérdida significativa de su diversidad genética.

Paternal and maternal lineages of 33 Creole bovines (27 cows and 6 bulls) from the Center of Applied Ecology Simón I. Patiño (Ceasip) were determined by nuclear, mitochondrial, and Y chromosome DNA markers. DNA was extracted with the Wizard® Genomic Purification Kit. Maternal lineages were identified by mitochondrial DNA sequencing (D-loop region). Seven Y chromosome markers - two Simple Nucleotide Polymorphisms (SNPs) and five microsatellites (tandem repeat sequences) - were used to determine paternal lineages. Genetic diversity was estimated with 18 microsatellites markers. Data were analyzed with MStools, GenePop, and Arlequin software. Two European and two African mitochondrial haplotypes were identified in the maternal lineages. Two taurine and one cebuine paternal lineages were detected. Allelic diversity (n_a) was 6.11, expected heterozygosity (H_e) was 0.70, and observed heterozygosity (H_o) was 0.68. These values were similar to average values of Yacumeño and Saavedreño Creole (n_a= 6.39, H_e = 0.72, and H_o = 0.65). Allelic diversity in Ceasip bovines (n_a= 6.11) was also similar to Yacumeño Creole (6.82) and Saavedreño Creole (5.95) biotypes. Cluster and Principal Component analyses indicate that genetic material could be exchanged between populations without significant diversity loss.