Desde su comienzo, la noción de fundamentación (o dependencia) rige la Ontología Formal de la Tercera Investigación Lógica como eje del desarrollo de toda la teoría. La teoría de los todos y las partes como teoría pura de objetos anunciada en la introducción es abierta como teoría de objetos dependientes e independientes. La preeminencia de la fundamentación seguirá siendo confirmada hacia el final (§22) donde enfáticamente se la señala como la instancia que determina la unidad de las partes en un todo. En vista de esto podemos afirmar que ésta investigación se trata de la fundamentación, tanto o más que del todo y la parte.