En el "Seminario I", mientras está comentado la organización del yo en términos de "sistema", Lacan se pregunta si el fenómeno que se produce en el análisis que se da en llamar resistencia proviene de este "sistema", y lo hace en los siguientes términos: "¿acaso está allí la resistencia? ¿Es, sí o no, pura y simplemente la organización del yo lo que constituye, como tal, la resistencia?".
No obstante, en concepto de Lacan, esta resistencia no es la única ni tampoco quizá sea la fundamental. Hay una dimensión de la resistencia sobre la que Lacan nos llama la atención y es la referida a "la resistencia del deseo". En "La dirección de la cura y los principios de su poder" nos dice que es el deseo el que se resiste a ser domeñado por la sugestión del analista: "La resistencia del sujeto, cuando se opone a la sugestión, no es sino deseo de mantener su deseo. Como tal, habría que ponerla en la columna de la transferencia positiva, puesto que es el deseo el que mantiene la dirección del análisis, fuera de los efectos de la demanda"