Después de su viaje a la Patagonia Austral que duró aproximadamente siete meses -2 de octubre 1876, 8 de mayo 1877- Moreno no descansa. En forma inmediata dona al Gobierno de la Provincia de Buenos Aires su museo, el cual se incorpora al patrimonio público el 17 de octubre de 1877 con el nombre de Museo Antropológico y Arqueológico de Buenos Aires, nombrándoselo Director del mismo. Pero en marzo de 1879 recibe una nota del Gobierno de la Nación, firmada por el Ministro S. M. Laspiur, donde le dice que "... el señor Presidente de la República manda practicar una expedición a los territorios del sud bañados por el Océano Atlántico, y lo designa a usted para dirigir aquella importante operación”. “El señor Presidente espera que no se negará usted a desempeñar la comisión que se le confiere, agregando así un nuevo servicio a los que tiene ya prestados al país en este género de estudios”.