Adaptabilidad conformacional de las hélices centrales de apolipoproteína AI humana

Abstract

Diferentes estudios sugieren que la ApoA1 y las HDL poseen un rol protector contra la aterosclerosis y las enfermedades cardiovasculares (Rosenson 2012, Gursky 2015, Linsel-Nitschke 2005, Singh 2007). Las HDL llamadas nacientes discoidales (dHDL) están compuestas de dos moléculas de apoA-I, acompañadas de alrededor de 100 moléculas de fosfolipidos. El modelo más aceptado de dHDL es el modelo de cinturón doble (Segrest 1999), basado en la estructura cristalográfica de la apoA-I (Borhani 1997), y que consiste en dos moléculas de apoA-I en forma de anillo y apiladas de manera antiparalela, rodeando a la bicapa lipídica. Se propusieron dos posibles registros para este modelo. En el arreglo llamado LL5/5 las hélices 5 de cada cadena de apoA-I se encuentran encimadas, mientras que en el arreglo LL5/2 el primer aminoácido de la hélice 5 se encuentra encimado a la hélice 2. En este estudio se presenta un análisis y comparación de la estabilidad de partículas dHDL en los registros LL5/5 y LL5/2 del modelo de cinturón doble con una bicapa lipídica de DMPC usando simulaciones de dinámica molecular. También se compararon ambos modelos con datos experimentales del trabajo de Silva (Silva et al., 2005). En conjunto, estos resultados nos indican que ambos registros son igualmente estables, y que ambos modelos son comparables contra los datos experimentales actualmente disponibles de bibliografía.