Las críticas más extendidas a la teoría de la autonomía de Juan Carlos Puig se centran en la supuesta relación tanto con un determinado tipo de realismo, como con la guerra fría. Este tipo de análisis tiene por objeto cuestionar su vigencia. Explícitamente, Roberto Russell junto a Juan Gabriel Tokatlián sostienen: "…las concepciones tradicionales de la autonomía pensada para otras realidades internacionales y de América Latina no ayudan a captar el sentido y relevancia actual de esta noción ni constituyen una buena guía para orientar la política exterior de nuestros países…" (la cursiva es nuestra, Russell y Tokatlian, 2010, 13-14). Para reflexionar sobre esta aparente carencia de sentido en la actualidad, primero nos proponemos analizar, a partir de los principales postulados de realismo de Hans Morgenthau, cuál es su correspondencia con el pensamiento de Juan Carlos Puig, y en segundo lugar, cual es la incidencia de la Guerra Fría en el diseño teórico de este autor argentino.