Introducción: La enfermedad periodontal es una infección de origen bacteriano, cursa con un proceso inflamatorio crónico. La IL-1 y elTNF-α son potentes estimuladores de la reabsorción ósea. Objetivo: Identificar en saliva de pacientes con enfermedad periodontal, la presencia de IL-1yTNF-α en las fases preoperatorias, postoperatoria y de mantenimiento; y correlacionar la concentración de estos biomarcadores con parámetros clínicos periodontales. Material y Método: se tomó una muestra de 60 individuos, divididos en 2 grupos de 30 sujetos: un grupo de enfermos periodontales y otro de control, sanos. Se les realizó historia clínica, seriada periapical, índice de placa, medición de la profundidad de la bolsa periodontal y graduación de la movilidad dentaria. Se recogió muestras de saliva que se estudiaron por cromatografía gaseosa identificando los niveles de IL-1yTNFα. Los hallazgos de estos biomarcadores se correlacionaron con los aspectos clínicos y la progresión de la enfermedad. Resultados: Se registraron mayores niveles de IL-1yTNFα en los enfermos periodontales que en el grupo control. En la etapa de mantenimiento 7 pacientes presentaron niveles altos de los biomarcadores y recidiva de la enfermedad. Conclusión: los resultados obtenidos evidencian el valor de los biomarcadores como factor determinante al momento de establecer su incidencia en la gravedad de la enfermedad periodontal.