Se evaluó la interrelación entre las variables ambientales y los macronutrientes de la zona interna e intermedia del Canal Principal del estuario de Bahía Blanca. Se realizaron muestreos continuos a bordo de la embarcación del Instituto Argentino de Oceanografía durante el período octubre 2006- diciembre 2008 – Septiembre 2011. En cinco estaciones de la zona interna y seis del sector intermedio se midieron in situ los parámetros físico-químicos y se colectaron muestras para la determinación de NO2-, NO3-, NH4+, PO43-, Silicatos, Clorofila a y feopigmentos en el agua superficial. Los resultados obtenidos mostraron correlaciones positivas entre NH4+ y los otros macronutrientes; entre el NH4+ y la Materia Orgánica Particulada; y entre NO3-, PO43-, DSi y la temperatura, principalmente. Mediante el ACP se pudo determinar una separación según las fechas de los muestreos, lo cual demuestra la variación estacional de los parámetros.