Varias patologías de la mucosa bucal y de los huesos maxilares han sido relacionadas con el Virus Papiloma Humano (VPH). Aquellas conforman un amplio espectro: benignas, potencialmente malignas y malignas. Las más llamativas son las lesiones de estirpe odontogénica. El ameloblastoma es un tumor epitelial odontogénico localmente agresivo de frecuencia relativa de localización maxilar con la posibilidad de ser periférico. El carcinoma a células escamosas es la neoplasia más frecuente de la mucosa bucal. Como el VPH es un virus epiteliotrópico, sus funciones y la síntesis viral de su ADN se realiza a nivel de las células del estrato espinoso. Si bien la vía de contacto con el virus es la transmisión sexual, no puede dejarse de lado la transmisión vertical. Por este motivo existen lesiones pediátricas que se asociaron al virus tanto de bajo como de alto riesgo para la transformación a la malignidad. La técnica de reacción en cadena de la polimerasa (PCR) sigue demostrando su alta especificidad y sensibilidad para la identificación y sobre todo la genotipificación viral.