La tos convulsa, causada por la bacteria Bordetella pertussis, constituye una problemática de salud a nivel mundial a pesar de la elevada cobertura de vacunación. Las mejoras en las estrategias preventivas contra B. pertussis dependen en gran medida del esclarecimiento de los mecanismos que contribuyen a la persistencia de la bacteria en el huésped. Entre ellos, se ha propuesto como un mecanismo relevante el establecimiento de un nicho de sobrevida intracelular de B. pertussis en células del hospedador. El objetivo de la presente Tesis fue estudiar esta interacción e identificar factores bacterianos involucrados en dicho proceso. En primer lugar, se analizaron los cambios que ocurren en el proteoma de B. pertussis durante su adaptación al ambiente encontrado dentro de las células del hospedador. Posteriormente, se seleccionó un grupo de factores bacterianos identificados en el estudio proteómico, potencialmente involucrados en el establecimiento de nichos intracelulares, para continuar su caracterización. Estos factores fueron seleccionados por su posible rol en la captura de nutrientes y/o su eventual relevancia en la adaptación a las condiciones de estrés encontradas por B. pertussis en el estadio intracelular.